En 1954, los arqueólogos Florencia Müller y César Lizardi pusieron al descubierto un conjunto de monumentos piramidales con marcada influencia teotihuacana, una plaza con una estela discordial de influencia maya, yugos totonacos, influencia de las culturas de la costa del Golfo de México.

Se dice que hay aproximadamente 28 montículos: pirámides pequeñas cubiertas en las que no se ha realizado trabajo arqueológico.

Huapalcalco tiene una extensión de 39 hectáreas, donde viven más de 55 familias, dentro de las cuales se encuentra la Zona Arqueológica cercada en un perímetro de 4 hectáreas.

Por la ladera, entre los peñascos, se hunden las paredes dando forma a las conocidas cuevas del lugar, donde los lugareños suelen poner altares en los días de muertos.

Frente a la Cueva del Tecolote, se hallaron los restos de un hombre prehistórico que, según las pruebas de carbono 14 realizadas, se trata de un hombre que vivió hace 10 mil años. Los restos se encuentran en el Museo Nacional de Antropología e Historia de la Cd. de México, en la Sala Prehistórica.

En la parte alta del cerro, en el ángulo sureste, se localizó recientemente un basamento piramidal con talud y tablero construido de losas de piedra y revocado de estuco. Un monumento simétrico, aún no explorado, se encuentra en el ángulo noroeste al otro lado de la barranca que, entre los vecinos, conocen como “iglesias viejas”.